事實上，被赦免了的王世充最終也難逃一死，流放途中被人莫名其妙地刺殺了；而竇建德雖被押赴菜市場斬首，但由此造成的影響和風波卻沒有結束。
武德四年《621年》，攻打洛陽王世充的李世民，突然面臨王世充、竇建德兩大梟雄勢力前後夾攻的危險，處境十分艱難。
對於李世民來說，隻剩下兩大抉擇：一是撤出圍困洛陽城的軍隊，並完全退出好不容易占領的洛陽周邊城池，率軍返回關中，等於前功盡棄，以後再找時機從頭再來；
二是豁出性命搏一把，但早已疲憊不堪的唐軍絕對不是王世充、竇建德十數萬聯軍的對手，失敗的可能性很大。
然而李世民天生就有把不可能變成可能的想法和能力，他采取『圍鄭擊夏』的策略，先是在虎牢關之戰中大敗竇建德援救洛陽的十萬大軍，生擒了竇建德，接著又迫降了洛陽城的王世充，一舉消滅了竇、王兩大勁敵，贏得了唐朝統一天下的定鼎之戰。
然而，被押赴長安的竇、王兩位梟雄，李淵對他們的態度卻是截然不同，下詔赦免了王世充，同時又決意處死了深得民心的竇建德，這是為何，裡面有什麼深意嗎？
公元618年，在長安稱帝的李淵通過一系列的戰爭，相繼消滅了西秦薛舉、涼州李軌及河東的劉武周各割據勢力，在鞏固了關中根據地後，決定進兵關東。
在李唐一統河東、關中及河西隴右，消除後顧之憂時，關東的形勢也已發生了很大的變化，曾經是農民起義軍盟主的瓦崗軍李密，先是被洛陽的王世充擊敗，後又投降了李唐，因圖謀東山再起卻事敗被殺。
此時，關東地區以擁有河北的夏王竇建德，和占據洛陽自稱鄭帝的王世充兩人勢力最大，與關中的李唐三足鼎立，南方就蕭梁的蕭銑有一定的實力，其他的像杜伏威、輔公祏及林士弘等江淮割據勢力，不值一提。
武德三年《620年》，秦王李世民奉命率領大軍出潼關，進攻洛陽的王世充。
七月，李世民統率各軍駐紮於谷州，王世充則率三萬精兵在慈澗紮陣，雙方經過幾次試探性的交戰，互有勝負。
在摸清對方底細後，李世民一方開始占據上風，不但俘虜了王世充的大將燕頎，並攻克了回洛城。
接著，唐軍以迅雷不及掩耳之勢掃清了洛陽城附近的所有城池、據點，大軍進駐邙山。
到了九月，李世民率領500騎兵在觀察戰場地勢時，與王世充率領的一萬軍隊相遇，此戰李世民以少勝多再次打敗了王世充的軍隊，斬首3000級，還俘虜了王世充的大將陳智略，僅王世充一人逃脫。
面對持續勝利且強勢的唐軍，原先依附王世充的筠州總管楊慶派使者請求歸降，李世民十分高興欣然納之，並派李世勣率軍過去好生安撫楊慶的部眾。
沒想到楊慶的歸降帶來了連鎖反應，滎、汴、洧、豫等九州也紛紛向李世民歸降，王世充頓感大事不妙，急忙向河北的竇建德求救。
武德四年《621年》，李世民率精銳騎兵在北邙山紮陣，同時命大將屈突通率5000步兵渡水攻擊王世充，在雙方軍隊交戰的時候，李世民親自率領騎兵沖陣，且沖鋒在前，與戰場中的屈突通裡外呼應。
此戰從早晨一直打到下午，直殺得天昏地暗，王世充的軍隊不敵向後撤退，李世民則趁機指揮軍隊追擊，王世充的兩萬軍隊被俘斬達八千人，將戰線一直推到洛陽城下。
經過此次大敗，王世充再也不敢出城作戰，隻敢環城自守，以等待竇建德的到來。
面對城池堅固，又有王世充重兵防守的洛陽城，李世民雖然多次攻打，奈何總是失敗，洛陽城依然固若金湯。
眼見傷亡越來越多，再加上攻城士兵已疲憊不堪，隻好命令軍隊挖掘壕溝，環繞佈置，打算長期圍守，並從中想出破城的方法。
然後一個不利的消息傳來，讓李世民及其部屬徹底失去鎮定，是什麼消息呢？
原來是夏王竇建德率兵十餘萬來救援王世充，且軍隊已到達酸棗《今河南新鄉延津縣》，離洛陽已經不遠，情勢十分危急。
李世民經過多日圍城攻打，士兵早已疲憊不堪，現在又要面對竇建德的十餘萬大軍，帳下不論文臣還是武將都有了退卻之意，認為以一敵二不可能取得勝利。
例如蕭瑀、屈突通及封德彝，就表示目前的處境腹背受敵，恐不是萬全之策，請求退師到谷州觀看形勢。
而秦王李世民在綜合所有幕僚的意見後，隻是稍加考慮，就下定決心說道：王世充糧食快要吃完了，且好不容易攻占了洛陽城附近所有的城池、據點，我們都不用攻打，隻需要圍城一段時間，洛陽城必破，現在放棄就等於前功盡棄，今後若再攻打不但愈加艱難，且又要死傷很多士兵。
竇建德的軍隊新近攻破孟海公，十萬大軍看似來勢洶洶，但將士必然驕傲怠惰，驕兵則必敗，我軍可以分兵占據虎牢關，扼守山川要沖，以逸待勞。
若竇建德軍隊與我軍交戰，憑著虎牢關的艱險攻破敵軍是必然的，如果竇建德放棄救援，最多十日王世充就堅持不住自我崩潰了。
現在問題的關鍵是虎牢關剛剛歸附不久，力量薄弱，我們必須趕在竇建德之前到達虎牢關，以阻擋竇建德的大軍。
最終，李世民命令屈突通留下輔助齊王李元吉繼續圍困洛陽，而自己則親率全部即3500玄甲騎兵奔赴虎牢關。
經過連日晝夜不停地行軍，李世民先竇建德大軍一步到達虎牢關，不但接手了虎牢關的一切防務，且加強了守城力量。
竇建德十餘萬大軍到達虎牢關後，築營壘於板渚，因不知虎牢關內的詳情，於是在關外與李世民對峙了二十多天。
李世民見竇建德長期不與之交戰，就放馬在黃河北岸吃草來誘敵，竇建德果然上當，率全部兵馬到來，陳列軍隊在汜水之上。
李世民先是任憑竇建德的軍隊叫陣，就是不搭理，等到竇建德的士兵又累又餓、聲勢衰竭，將退欲退陣列混亂時，馬上發動進攻。
李世民率領史大奈、程咬金及秦叔寶等大將揮動大旗沖入，直接突入到陣後，然後張掛起軍旗。
竇建德的士兵回頭看到唐軍的旗幟，以為被包圍，紛紛四散逃命，最終導致全軍崩潰。
李世民則趁機率領騎兵追擊攻打三十裡，斬首三千多人，俘虜敵軍五萬，並在陣中活捉了竇建德。
李世民見竇建德被活捉，剛一見面就責備他道：『我攻打王世充，幹你什麼事，為何要率大軍來打我』竇建德則不緊不慢地說道：『我現在不來，日後還得麻煩你跑老遠去找我』雖是大實話，但聽來令人啼笑皆非，一代梟雄竇建德就這樣落幕了。
李世民率軍隊回返洛陽城下，城頭上的王世充看見被關在籠子裡的竇建德，知道大勢已去，在恐懼中帶領兩千多大小官吏開城門，並主動到唐軍營請求歸降。
至此，關東地區全部平定，本來李唐的戰略目標是擊敗洛陽的王世充，沒想到順帶把河北最大的割據勢力竇建德也給滅了。
竇建德和王世充雖然都被李世民俘虜，但他們都曾稱王或稱帝，對於他們的處置不是李世民可以擅自決定的，因此在處理好洛陽的全部接收工作後，就將竇建德和王世充押赴長安。
對於竇建德和王世充的處置問題，李唐朝廷有過一番爭議，秦王李世民認為竇建德不當殺，因為竇建德在河北有很大的影響力，殺了他容易引起其以前的部下反抗，從而引發河北的動蕩不安；而王世充是主動歸降的，且李世民許諾過不殺他，如果失信於人，其他割據勢力誰還敢投降李唐。
而太子李建成則認為，竇建德出身草莽，卻帶領農民起義反抗官府、朝廷，且擅自割據河北稱王，殺他正可以震懾天下草莽的造反之心；對於王世充也贊成不殺，理由是他是前隋官員、貴族，再加上主動請求歸降，所以死罪可免。
最終，唐高祖李淵下詔將王世充流放到蜀地，而竇建德則直接押往菜市場斬首，同時又強征竇建德的舊將范願、董康買、曹湛、高雅賢及王小胡等人到長安。
同樣是造反的梟雄，李淵卻區別對待，處置明顯不同，這其中，自然有他的深層意義和考慮。
一是對朝局平衡的考量，偏向太子李建成以打壓秦王李世民的勢力。
李世民一戰擊敗王世充、竇建德中原兩股最大的割據勢力，平定關東，奠定唐朝統一天下的勝局。
李淵大喜過望，對這個引以為豪的兒子大加封賜和獎賞，他認為自古以來舊的官階與特殊功勞不相稱，於是另外發徽號，以表彰李世民的功勛德望。
先是在秦王的基礎上加天策上將封號，位在王公之上，同時加三公之二的司徒，封陜東道大行臺尚書令，增加食邑兩萬戶，連上之前的一共三萬戶。
天策上將府可以自設官署，自行任命官員，這就擁有了人事任免權，且不受朝廷吏部的幹涉監督；而陜東道大行臺尚書令，則是擁有了函谷關以東廣大區域的治權；至於食邑三萬戶，代表著擁有足夠的錢糧、財物來養兵、養幕僚。
再加上秦王府謀士如雨、猛將如雲，除了沒有太子之名，其勢力、實力遠在太子李建成之上，就算太子和齊王李元吉聯合起來也不是秦王的對手。
為了朝局的穩定，李淵不得不扶持太子的勢力而打壓秦王李世民，以平衡他們兩人的關系。
雖然知道竇建德在河北有名望、有人心，殺他可能引起河北動蕩，但依然否定了李世民的建議，而是選擇支持太子李建成的想法，且李建成的想法出發點也是好的，並沒有錯，出身貴族的李淵不可能對出身草莽的竇建德有好感。
至於強征竇建德的舊將，是不想給李世民收攏人才及人心的機會，因為李世民帳下的幕僚人才、將領，很多就來自被打敗的對手，像尉遲敬德是收降的劉武周手下大將，而降將李勣、程咬金、秦瓊則分別來自瓦崗軍和王世充。
二是心裡贊同太子李建成的想法，殺竇建德可以震懾天下草莽造反之心。
李淵出身世家貴族，遠祖可追自十六國時期西涼的開國君主李暠，祖父是西魏八柱國之一的李虎，李淵自己從小就世襲唐國公爵位，西魏、北周、隋唐朝代的更替都隻在貴族之間，是既得利益階層。
而竇建德出身農民，起義反抗官府、朝廷，是對既得利益階層的挑戰，不但讓李淵內心深處感到恐懼，同時又深痛惡絕，於是順水推舟支持了太子李建成的想法，將竇建德押往菜市場斬首，明正典刑以震懾天下庶民百姓造反之心。
對於王世充，除了他主動請求歸降，有立功表現，還因為他是李淵在前朝的官場同僚，也是官宦出身，因此李淵對他的態度明顯要和緩很多，施以懷柔政策收買、團結前朝官吏之心，所以將其流放蜀地。
然而事情果然不出秦王李世民所料，竇建德被殺的消息一傳到河北，其舊部劉黑闥等立馬打著為竇建德復仇的名義聚眾起兵，多次擊敗唐軍，突厥趁機派兵相助，已經歸降唐朝的徐圓朗等也舉兵響應，一時間聲勢大振，已經平定的河北又動亂起來。
武德五年《622年》，李世民在洺水之戰中大破劉黑闥，使其逃奔突厥，此戰雖贏得了戰爭，卻仍然沒有贏得河北的人心。
果然，數月後劉黑闥卷土重來再次反叛，直到次年《623年》被李建成率領的軍隊所破，劉黑闥、徐圓朗相繼被殺，河北才重新平定，至於河北人心則始終難以收服，其後安祿山的反叛、河北三鎮，一直到唐朝的覆滅。
由此可見，當初竇建德被殺所造成的嚴重後果，殺一人而失河北人心，沒想到唐高祖李淵一時的輕率決定，卻為唐朝的衰敗埋下了伏筆，同時也證明了李世民確實有先見之明。
竇建德草莽造反失敗被殺，而準備流放蜀地的王世充最終也難逃一死，在長安附近被人莫名其妙的刺殺了，這是怎麼回事？
按照旨意，王世充與其兄王世惲及老婆、孩子一起被流放蜀地，因押解人員還沒有準備好，於是王世充一家暫時被關押在長安附近的雍州。
一天，突然來了幾個官吏稱李淵有旨，要王世充接旨，王世充急忙率領家人出門迎接，不料那幾人二話不說立刻亂刀齊下，王世充就這樣被殺了。
事後查明，那幾人中帶頭的是唐朝定州刺史獨孤修德，據說他的父親獨孤機原本是王世充的部下，在武德二年正月企圖降唐，卻被王世充所殺，因此獨孤修德殺王世充是為父報仇。
不久，王世充先行一步的兒子王玄應和哥哥王世偉等人，也在流放途中因陰謀叛亂被處死。
據史書記載，獨孤修德冒旨擅殺被李淵赦免了的王世充，而唐高祖李淵隻是下詔免了獨孤修德的官職，不久後又重新啟用，官至同州刺史，封滕國公。
再加上王世充的兒子王玄應和哥哥王世偉等人，在武器全無的情況下卻陰謀叛亂，這些都不得不讓人懷疑，其背後的主使者是李淵？而所謂的獨孤修德報父仇事件，也隻是為了不留後患而制造的假象？
然而，不論歷史真相如何，王世充敢篡位稱帝，在失敗後，就應該有全族被誅殺的心理準備，就算僥幸躲過了一時，也逃不了一世，更不要高估帝王的仁恕之心及低估帝王權術。