1864年7月，湘軍向圍困了數月之久的太平天國的都城天京發動了最後的猛攻，城破之前天王洪秀全病逝，忠王李秀成眼看大勢已去，極力保護幼天王洪天貴福突圍，逃亡途中，洪天貴的馬摔壞了，李秀成將自己的馬讓他騎。
結果很不幸，他被俘虜了。
李秀成被擒後，為了太平天國的『復興夢』，他在獄中寫下了數萬字的《自述書》，述說自己參加革命之具體經過，以及太平天國之成敗得失，最後把矛盾指向西方列強，指出洋人才是中華最大的隱患。
令人稱奇的是，李秀成在《自述書》中對天京事變進行了詳細的描述，李秀成指出 『天京事變』的爆發，就是因為楊秀清太過囂張，目中無人，甚至連天王洪秀全都不放在眼裡。
洪秀全在忍無可忍的情況下，密令『首義五大王』的韋昌輝、石達開兩大天王回京，商議誅殺楊秀清之事。
並一語道破韋昌輝誅殺東王殿2萬人之謎團。
先來看這段原文： 『翼與北王密議，殺東一人，殺其兄弟三人，原清輔清而已，除此以外，俱不得多殺』
意思就是說，可見洪秀全當時還是相當理智，不想因誅殺太多而讓太平天國元氣大傷，給清廷可乘之機。
讓韋昌輝和石達開隻殺楊秀清、楊輔清、楊原清3人便可，不得濫殺無辜。
而在誅殺東王楊秀清這件事上，北王韋昌輝與翼王石達開是盟友，站在同一條線上。
當然，洪、韋、石三人的『反楊同盟』到最後卻演變成了韋昌輝一人單幹，而洪秀全和石達開卻『作壁上觀』，洪秀全坐鎮天王府遙控指揮，而石達開為了不卷入這場內訌，故意遲遲不入京來。
韋昌輝進城後，箭在弦上，不得不發了，無奈之下，隻好拉攏了一個人——燕王秦日綱。
韋昌輝和秦日綱都被楊秀清杖責過，對楊秀清恨之入骨。
兩人自然是一拍即合。
然而，結果卻並非如此，先入城的韋昌輝，聯合燕王秦日綱，率三千精兵殺入東王府後，在誅殺楊秀清的同時，還把東王府上下殺了個人仰馬翻，結果有2萬多無辜人士死於這次政變。
太平天國元氣大傷，由盛轉衰，一步步走向滅亡，再無翻身之可能。
那麼，明明說好隻殺3人，為何最終卻誅殺了2萬多人呢？
世人把『罪魁禍首』都指向狠毒的韋昌輝。
其實，事實並沒有客以簡單，這後面還有更深層次的原因。
首先，韋昌輝有苦衷。
在整個東京事變中，洪秀全和石達開都躲在暗處，特別是洪秀全，他並沒有公佈『誅楊詔書』，斥責楊秀清罪行，承認事變的合法性，而是『暗中』讓韋昌輝進行軍事行動。
這樣一來，盡管韋昌輝帶兵回京誅殺楊秀清，打著是『奉詔勤王』旗號，是名正言順的替天行道。
但是，楊秀清死後，洪秀全並沒有及時公佈詔書來，這樣一來，韋昌輝就陷入進退兩難的境地了，他自己說『奉詔討賊』，但『罪人』楊秀清伏誅，而洪秀全沒有公佈詔書，也沒有站出來公開表態。
單憑韋昌輝一面之詞顯然是很難服眾的。
其次，楊秀清有『後臺』。
楊秀清當然不是一個人，而是代表一個太平天國集團最大的集團——東殿集團。
天京事變後，盡管韋昌輝第一時間殺死了楊秀清，但東殿集團的實力還存在，東殿禮部尚書護天侯傅學賢、戶部尚書翊天侯吉成子等能調動之在京東殿兵馬約6000人。
而當時韋昌的兵馬才3000人，因為沒有天王詔書，韋昌輝誅殺楊秀清屬於『不合理』行為，因此，東殿集團必然會反擊，一方面為楊秀清報仇，另一方面為了生存。
同時，東殿集團裡的『二號人物』傅學賢平時仗著楊秀清的權威，囂張跋扈，甚至連北王、翼王都不放在眼裡。
而這時，聽聞楊秀清已死，傅學賢的反擊是必然，否則就隻能束手被擒的份了。
事實上，東殿集團也的確馬上采取了行動，他們在傅學賢和吉成子的帶領下，利用街壘與韋昌輝3000兵馬展開激烈的惡戰。
因為人數在原因，韋昌輝一度處在下風，情況非常危急。
正在這個關鍵時刻，燕王秦日綱帶兵而來，從而幫助韋昌輝扭轉了戰局，最終反敗為勝，將在東殿的6000兵馬悉數殺掉，基本控制了天京局勢。
就在韋昌輝大開殺戒時，石達開從武昌洪山大營回京了。
其實石達開和韋昌輝的關系應該是非同一般的，據李秀玉的自述書裡記載：『翼王在湖北洪山，知到京城害殺許多之人，在湖北洪山營中，同曾錦謙、張遂謀狼狽趕回京都，計及免殺之事』可見石達開回京竟然隻帶兩人，足以證明他和韋昌輝的私交甚好。
石達開回到天京後，他明明是密謀者之一，卻『直斥』韋昌輝：『其下何罪？
何得盡戮？
無乃自戮手足』，並將楊輔清保護起來，公然站在東王餘黨一邊。
為此，李秀成在《自述書》所說，『天王亦不悅』，北王也『頓起殺心』，一怒之下，他準備幹掉石達開。
可惜，石達開早有預防，他連夜縋城而出，跑回安慶號召舊部起來『靖難』，討伐韋昌輝。
韋昌輝眼看形勢危急，索性一不幹二不休，血洗翼王府後直接攻打天王府，希望能活捉洪秀全達到『挾天子以令諸侯』之目的。
令石達開勤王大軍不敢妄動，同時，他把自己的弟弟韋俊從武昌調回的，以扭轉不利局勢。
結果，韋昌輝的如意算盤落空了。
因為他的盟友燕王秦日綱在追擊石達開末果後，率軍離開天京去『抗清』去了。
失去一臂的韋昌輝當然不是洪秀全的對手，最終兵敗身死，首級被送到了石達開面前。
因此，韋昌輝之所以把天京事變極力上綱上線，擴大化，從密議時說好的隻殺3人，結果卻殺了2萬多人，歷史上把主責都推到了韋昌輝身上，而實際上，洪秀全沒及時公佈『誅楊詔書』才是最關鍵的一步，而石達開隨後的『逼宮』讓事態進一步惡化。
因此，主責第一人應該是洪秀全，而主責第二人是石達開，第三人才是韋昌輝。