九月二十九日，因為陳霸先消滅了王僧辯。
背靠北齊即位僅四個月的蕭淵明不得不宣佈退位，群臣一齊向晉安王蕭方智上表，勸說他登基稱帝。
十月二日，蕭方智正式登基即位，大赦，改元紹泰，以蕭淵明為司徒，封建安公。
向北齊派出使者說;”王僧辯陰謀作亂，已經伏誅。
“並請求繼續向北齊稱臣，永做北齊的附屬國。
北齊朝廷派遣行臺司馬恭與南梁使者在歷陽結下盟約。
蕭方智就是南梁最後一位皇帝梁敬帝。
十月五日，南梁朝廷任命陳霸先為尚書令、都督中外諸軍事、車騎將軍、揚南徐二州刺史。
十月六日，又任命宜豐侯蕭循為太保，建安公蕭淵明為太傅，曲江侯蕭勃為太尉，王琳為車騎將軍、開府儀同三司。
北齊軍隊撤離郢城以後，蕭循占領了郢城，被任命為郢州刺史;蕭勃仍然是廣州刺史;王琳時任湘州刺史;這三位已儼然小的割據勢力，他們雖然都與後梁的蕭譽政權為敵，但對陳霸先擁立的南梁蕭方智態度曖昧，南梁朝廷此舉也有拉攏他們的意思。
不久，南梁朝廷征召蕭循、蕭勃入京，蕭循與蕭勃均不從命。
杜龕身為王僧辯的女婿，王僧辯把他安排在吳興《浙江省湖州市》，其實就是為了監視陳霸先。
吳興又是陳霸先的老家，杜拿素來看不起陳霸先，經常制裁陳霸先家族裡的人，早已引起陳霸先的不滿。
等到陳霸先決心偷襲王僧辯之前，他也提前讓侄兒陳倩秘密回到吳興老家長城《浙江省長興縣》，修築木柵，做好迎擊杜龕的準備。
王僧辯被殺的消息傳來，杜龕占據吳興抗拒陳霸先，義興《江蘇省宜興市》太守韋載、吳郡《江蘇省蘇州市》太守王僧智也起兵響應。
陳蓓來到長城，才招募了數百人，杜龕就已經派部將杜泰率領五千精兵突然殺來。
陳倩下屬都大驚失色，而陳猜卻不慌不忙，從容部署軍隊，看到主帥這樣，下屬們這才安定了下來。
杜泰率軍不分晝夜向陳蓓的營壘發起猛攻，但接連進攻了數十天依然無法攻下，隻好撤退。
陳霸先在偷襲王僧辯的同時，即命令周文育率軍奔襲義興，周文育還未到義興，就被韋載發覺，韋載閉城固守。
義興所屬各縣的軍隊都是陳霸先的舊部，擅長使用弩箭，韋載把他們集中起來，挑選了數十人，用長鐵鏈鎖住，命令親信在一旁監視，讓這些人朝周文育的部隊射擊，並約定∶”射十發只要有兩發射不中的，格殺勿論！”在韋載的嚴令下，這些人是百發百中，將周文育部隊的進攻氣焰打了下去。
看到周文育的部隊退去後，韋載這才下令在義興城外沿著河水修築工事，兩軍相持了數十天之久。
杜龕派堂弟杜北叟率軍出戰，被擊敗後，杜北叟逃到了義興。
陳霸先聽說周文育出師不利，上書梁敬帝請求親自率軍東征，留下侯安都、杜棱鎮守建康。
十月二十七日，陳霸先率軍抵達了義興，二十九日，即攻克了韋載在城外修築的堡壘。
譙、秦二州刺史徐嗣徽的堂弟徐嗣先是王僧辯的外甥，王僧辯死後，徐嗣先投奔徐嗣徽，徐嗣徽獻出州郡，向北齊投降。
等到陳霸先率領主力東征以後，京師空虛，徐嗣徽暗中聯絡南豫州刺史任約，率領五千精銳部隊乘虛偷襲建康。
就在陳霸先剛剛攻破義興城外工事時，徐嗣徽和任約的軍隊也一舉攻克了建康城外的石頭城，偵察騎兵一直進抵宮城城下。
侯安都連夜備戰，快天明的時候，徐嗣徽等人又率部殺到城下。
侯安都率領三百名將士打開東西掖門出戰，大破敵人，徐嗣徽等人倉皇挑回石頭城，從此不敢再進逼宮城。
韋載的同族弟弟韋蝴是陳霸先的參軍，陳霸先派他入城說服韋載，十月三十日，在陳霸先抵達義興三天後，韋載、杜北叟即出城投降。
陳霸先對二人厚加安撫，任命韋期為監義興郡，把韋載留在自己身邊，充當參謀。
神速平定義興後，建康危急的消息也傳來了，陳霸先命令周文育率軍繼續南下討伐杜龕，他自己則率軍倍道兼行，火速折返建康。
將軍黃他率領另外一部人馬進攻吳郡的王僧智，也沒有攻下來，陳霸先又派遣寧遠將軍裴忌增援。
裴忌挑選出精兵，從錢塘《浙江省杭州市》向吳郡《江蘇省蘇州市》撲來，深夜來到吳郡城下，在城外擂起戰鼓，大聲吶喊，王僧智也風聞義興投降的消息，認為陳霸先的大軍已經到了，嚇得魂不附體，慌慌忙忙逃出城去，逃往吳興《浙江省湖州市》。
裴忌遂進入吳郡，陳霸先順勢任命他為吳郡太守。
當徐嗣徽、任約南下的同時，已請求北齊發兵支援。
十一月二日，北齊派遣五千人馬渡過長江，占領了姑熟《安徽省當塗縣》，支援徐嗣徽和任約。
陳霸先命令合州刺史徐度在冶城《江蘇省南京市西南》修築防禦工事。
十一月三日，北齊又派遣安州刺史翟子崇、楚州刺史劉士榮、淮州刺史柳達摩率領一萬軍隊從石頭城對面的胡墅給石頭城內的徐嗣徽和任約運來三萬石米、一千匹戰馬。
陳霸先向韋載征詢對策，韋載回答∶”北齊軍隊如果分兵進攻切斷京師與三吳之間的聯系，奪取三吳之地的話，則大事去矣。
如今，要立即在秦淮河南岸構築防禦工事，以保障與三吳地區之間聯絡的暢通，再分出一部分兵力切斷敵人的糧道，不出十日，北齊軍主將的人頭就能到手。
“陳霸先聽從了。
十一月六日，陳霸先命令侯安都夜襲胡墅，焚燒了一千多艘北齊戰艦，又命令仁威將軍周鐵虎切斷了北齊軍的糧道，生擒北齊北徐州刺史張領州。
陳霸先還命令韋載整修大航《朱雀橋》旁邊侯景殘存的堡壘，令杜棱率軍駐守在那裡。
北齊軍隊在石頭城的倉門外面和秦淮河南岸構築了兩座營壘，與南梁軍隊相持。
十一月十五日，北齊大都督蕭軌領兵駐紮在長江北岸。
十一月二十七日，徐嗣徽等人進攻南梁冶城營壘，陳霸先率領精銳部隊從臺城西明門出擊，大破徐嗣徽等人。
失敗後，徐嗣徽留下柳達摩等人守住石頭城，親自前往采石《安徽省當塗縣北長江渡口》迎接北齊援軍。
十二月七日，侯安都率軍渡過長江，奔襲秦郡，擊破徐嗣徽的老巢，生擒數百人。
侯安都的軍隊闖入徐嗣徽的私宅，搜出他的琵琶和獵鷹，派人送給身在前線的徐嗣徽，並稱∶”昨天在弟弟家裡得到這些東西，現在如數奉還。
“徐嗣徽見狀大驚。
十二月十日，陳霸先正對著冶城修築浮橋，南梁軍隊從浮橋上全部渡過了秦淮河，進攻徐嗣徽在秦淮河南岸的兩座營壘。
石頭城守將柳達摩等人率軍也渡過秦淮河迎戰，陳霸先都督各軍朝敵人發起猛攻，南梁軍縱火焚燒了北齊軍隊的木柵，北齊軍大敗，爭先恐後地搶奪船隻逃命，被水淹死了上千人，北齊軍的戰艦全部被南梁軍繳獲。
當天，徐嗣徽與任約引導一萬餘名北齊軍隊，準備回到石頭城，陳霸先提前派兵駐紮在江寧，占據了險要位置。
徐嗣徽等人不敢繼續前進，停留在江寧浦口《江蘇省南京市長江對岸》，陳霸先派侯安都率領水軍將其擊破，徐嗣徽等人落荒而逃，南梁軍又大獲全勝。
十二月十三日，陳霸先率軍從四面八方對石頭城發起了總攻，城內沒有水源，一升水能賣到一匹絹的價錢。
十二月十四日，柳達摩派侯子欽、劉仕榮等人求和，但請求陳霸先送來人質。
當時，建康城內非常空虛，糧道也未完全暢通，很多大臣都建議與北齊和解，並請求將陳霸先的侄兒陳曇朗送給北齊人當人質。
陳霸先說∶ “現在諸位大人們打算與北齊人實現和解，如果我違背了大家的意見，大家會說我是心疼陳曇朗，卻不以國家為重，因此，我決定把陳曇朗送給敵人當人質。
北齊人言而無信，我們這麼做，他們會認為我們軟弱，肯定會違背盟約的。
北齊如果再次入侵，你們大家可要替我殊死搏殺啊！”遂以侄兒陳曇縣朗、永嘉王蕭莊、丹陽尹王沖的兒子王氓為人質，與北齊人在建康城外結下盟約。
《北齊書·蕭明傳》稱;”霸先奉表朝廷，雲僧辯陰謀篡逆，故誅之。
方智請稱臣，永為藩國，齊遣行臺司馬恭及梁人盟於歷陽。
“就是記載的此事。
十二月十五日，陳霸先率領南梁軍在石頭城南門列下陣勢，送北齊人撤離，徐嗣徽和任約也都逃奔北齊。
陳霸先繳獲了北齊軍留下的馬匹、武器、戰艦、糧食，不計其數。
北齊合州長史烏丸遠從南州《安徽省和縣長江小島》逃回歷陽《安徽省和縣》。
北齊文宣帝高洋得知柳達摩損兵折將，又與南梁結盟，不禁大怒，誅殺了柳達摩。
陳曇朗當時為監南徐州事，陳霸先擔心陳曇朗不願北去，親自率領軍隊回到京口，等於是把他押回建康，然後送給了北齊。
顯然，此時陳霸先並不想與北齊為敵，他試圖將誅殺王僧辯事件帶來的影響盡可能限定在南梁內部權力鬥爭的范圍，仍然繼承了王僧辯的與北齊和好的對外政策，這當然是陳霸先審時度勢的結果，史書上將陳霸先這一舉動描寫成是在南梁群臣的壓力下不得已而為之，應該是出於對陳霸先的擁護，因為，北齊文宣帝高洋對陳霸先並不領情，這讓他很沒面子。
轉眼就到了公元556年，即紹泰二年，三吳的戰事仍在進行中。
陳蒂、周文育合軍一處，一起朝吳興撲來。
杜龕的軍隊人數尚多，步兵與水軍結下連環陣，切斷了交通要道，但杜龕有勇無謀，又嗜酒如命，經常昏醉不醒，他的部下杜泰見前途無望，遂暗中與陳蒂等人聯絡，準備歸降。
杜龕與陳倩作戰，戰敗，杜泰趁機勸說他投降，杜龕同意了，但他的妻子王氏說∶ “我家與陳霸先結下了如此深仇大恨，豈能投降！』王氏拿出家財，犒賞將士，杜龕率軍再次出戰，大破陳蒂等人。
但不久，杜泰就投降了，陳蒂率軍突入城中，杜龕尚爛醉如泥，呼呼大睡，陳倩命人將其背出房來，在項王寺前殺掉了。
王僧智與弟弟王僧惜逃往北齊。
東揚州刺史張彪是王僧辯的心腹，一直沒有歸附陳霸先，他率軍包圍了依附於陳霸先的臨海《浙江省臨海市》太守王懷振，王懷振派人向陳倩求救。
二月五日，陳蒂、周文育乘虛率軍偷襲會稽《浙江省紹興市》張彪的老巢，張彪部將沈泰開門投降，陳禱俘虜了張彪的家眷，收編了城內張彪的部隊。
等到張彪聞訊率軍回來，又被陳蒂擊敗，逃入若邪山中，陳蒂派章昭遠將其斬殺。
東陽《浙江省金華市》太守留異接濟陳蒂軍糧，陳霸先遂任命其為縉州《浙江省金華市》刺史，任命陳蓓為持節、都督會稽等十郡諸軍事、宣毅將軍、會稽太守。
三吳地區基本被平定，但建康的局勢依然不容樂觀，陳霸先能夠控制的地區也隻有三吳和建康周邊巴掌大一塊土地，長江以北的北齊以及戰敗的任約、徐嗣徽還虎視眈眈，隨時想卷土重來。
就連緊鄰的江州也不服從建康政權。
江州刺史侯填原是王僧辯的部下，得知王僧辯被殺後，他也起兵與陳霸先為敵。
在平定三吳、擊退北齊入侵之後，陳霸先就將目光轉向了江州，他任命周文育為南豫州刺史，命他率軍西進，進攻滋城《江西省九江市西北》。
二月十五日，陳霸先又派侯安都、周鐵虎率領水軍在梁山《安徽省和縣與當塗縣之間長江江心島》構築防禦工事，防備來自江州侯填可能發起的攻擊。
二月十八日，任約、徐嗣徽率軍偷襲采石《安徽省當塗縣北長江渡口》，活捉了南梁明州刺史張懷鈞，將其送交北齊。
三月七日，北齊文宣帝高洋派遣儀同三司蕭軌、庫狄伏連、堯難宗、東方老等人與任約、徐嗣徽合兵十萬，向南梁發起了大規模的進攻。
北齊軍從柵口《濡須口，安徽省巢縣東南》出發，直指梁山。
陳霸先帳內蕩主黃叢率軍迎戰，將齊軍擊敗，齊軍向西撤去，占領了蕪湖。
陳霸先又派定州刺史沈泰等人率軍增援侯安都，一起固守梁山。
周文育進攻淞城失利，陳霸先也將其召回，集中兵力對付北齊軍。
四月十三日，陳霸先親自來到梁山，巡視部隊，給將士們打氣。
同月，侯安都率領輕裝部隊奔襲歷陽，大破北齊行臺司馬恭，俘獲上萬敵人。
五月，北齊人征召建安公蕭淵明，並謊稱如果送來蕭淵明，就會撤軍，陳霸先不敢怠慢，命人安排船隻準備將蕭淵明送到北齊軍中，但不巧的是，五月九日，蕭淵明背上的毒瘡潰爛竟然死掉了。
五月十日，北齊軍隊從蕪湖出動，朝建康殺來。
十六日，北齊軍隊進入丹楊縣《丹陽縣，在今安徽省當塗縣東》，五月二十二日，北齊軍隊進抵襪陵舊縣《江蘇省南京市江寧區東南》。
陳霸先派遣周文育率軍駐紮在方山《一名天印山，在今江蘇省南京市江寧區東南》，徐度駐紮在馬牧《牧馬場，在今江蘇省南京市江寧區南》，杜棱駐紮在大航《朱雀橋》以南，與北齊軍相持。
五月二十七日，北齊軍隊在秦淮河上搭建木柵便橋，渡過了秦淮河，當晚進抵方山山下，徐嗣徽等人率領水軍停泊在青墩《安徽省當塗縣西南二十裡，今名青堆沙》至七磯《確址不詳，疑為在今江蘇省南京市秦淮河入長江口附近》一線，切斷了周文育所部的退路。
周文育率部擂鼓吶喊出擊，徐嗣徽等人無力制止，等到天明時，周文育率軍向徐嗣徽所部發起反攻。
徐嗣徽軍中猛將鮑砰乘坐一條小船斷後，周文育駕駛一條小舟直取鮑砰，隻見他縱身一躍，跳上鮑砰的小船，一刀將其斬為兩段，然後，拖著鮑砰的小船回到本陣。
徐嗣徽軍人見狀大為驚駭，遂不敢與周文育水戰，徐嗣徽將戰艦留在蕪湖，率領軍隊從陸路出擊。
陳霸先侯安都、徐度所部也都召回到京師。
五月二十九日，北齊軍隊從方山推進到倪塘《江蘇省南京市江寧區東南》，偵察騎兵一直抵達到臺城城下，建康震動，梁敬帝蕭方智率軍駐紮在長樂寺內，宣佈內外戒嚴。
陳霸先在白城《江蘇省南京市江寧區東湖熟鎮附近》抵禦徐嗣徽，剛巧與周文育所部會合。
雙方將要交戰，突然刮起了大風，陳霸先說∶”兵法說大軍不能逆風作戰。
“周文育卻說∶”事情危急，管不了那麼多了！”說完，抽出長槊拍馬朝敵人陣中殺去，士兵們也緊隨其後，蜂擁而上，而不久風向也轉了，梁軍殺傷了數百敵人。
侯安都與徐嗣徽等人在耕壇《皇帝的責任田，江蘇省南京市通濟門外》交戰，侯安都親率十二名騎兵朝北齊軍陣突擊，一舉擊破敵人，生擒北齊儀同三司乞伏無勞。
取勝之後，陳霸先又避實擊虛，暗中從前線撤下三千精兵交給沈泰，命其偷偷渡過了長江，奔襲駐紮在瓜步《江蘇省南京市六合區東南長江渡口》的北齊行臺趙彥深，繳獲了一百多艘戰艦、一萬斛糧食。
六月一日，北齊軍隊偷偷運動到鐘山，侯安都與北齊將領王敬寶在鐘山西麓的龍尾交戰，梁軍軍主張篡戰死。
六月四日，北齊軍隊推進到幕府山，陳霸先派遣部將錢明率領水軍從江乘《江蘇省儀征市長江南岸渡口》出擊，切斷北齊軍隊的糧道，繳獲了北齊的運糧船，北齊軍隊軍糧不足，開始殺死馬匹、驢子充饑。
六月七日，北齊軍翻越鐘山，陳霸先率領各軍分別駐紮在樂遊苑以東《江蘇省南京市覆舟山以南》一直到幕府山北麓，切斷了北齊軍進攻建康的通道。
六月九日，北齊軍推進到玄武湖西北，打算占領北郊壇，南梁軍隊也從覆舟山以東移動到北郊壇以北，與北齊軍隊相持。
當時，連日大雨傾盆，建康近郊平地積水一丈多深，北齊軍人日夜坐在泥地之中，腳趾全被泡爛，隻能把鍋灶懸著才能煮飯，可是，臺城以及潮溝以北沒有被水淹，地面幹燥，南梁軍隊可以輪番休整。
然而，此時的建康也非常危急，建康已如同一座孤島一般，與外界隔絕，糧道也被北齊軍隊切斷，城內的百姓也都逃離建康，想強行征發也沒有了對象。
六月十一日，天氣稍稍轉晴，陳霸先打算對北齊軍隊發起進攻，千方百計搞來些米飯分給士兵們，但士兵們仍然又饑餓又疲憊，難以戰鬥。
正巧陳蒂從三吳地區送來三千斛大米、一千隻鴨子，陳霸先立即命人煮米宰鴨，全軍將士都能分得一份荷葉煲飯，數片鴨肉。
第二天天還未亮，陳霸先命令部隊飽餐戰飯，即率軍從幕府山出擊。
陳霸先與吳明徹、沈泰等人一齊朝北齊軍殺來，雙方縱兵大戰，正在難分難解之際，侯安都率軍又從白下《江蘇省南京市北》朝北齊軍背後殺來，頓時北齊軍大敗，梁軍一直追殺到臨沂《僑郡，在今江蘇省句容市北》。
此戰梁軍共斬殺了齊軍數千人，生擒徐嗣徽及其弟弟徐嗣宗，斬首示眾，齊軍士兵相互踐踏而死的數不勝數。
緊接著，梁軍乘勝收復了江乘、攝山《棲霞山》、鐘山等地，生擒蕭軌、東方老、王敬寶等四十六名北齊將帥。
北齊軍士僥幸逃到長江岸邊的，用荻草編成木筏過江，好不容易劃到江心，木筏就解體了，人落入水中淹死，屍體漂流到下遊的京口，密密麻麻地佈滿了江岸，此戰，北齊將領任約、王僧恰二人僥幸逃出一命。
六月十四日，大勝後的各路梁軍又來到南州，焚燒了北齊的戰艦。
六月十五日，南梁宣佈大赦。
十六日，解除戒嚴狀態。
官兵們把賞賜給的財物拿去換酒，才夠一人喝醉。
十七日，南梁朝廷誅殺了北齊將領蕭軌等人，北齊人聽說後，也殺死了作為人質的陳曇朗。
陳霸先為了報答侯安都，上書梁敬帝，將自己兼任的南徐州刺史一職讓給了侯安都。