在是否接納蕭淵明這一問題上，陳霸先與王僧辯的意見並不一致，而蕭淵明的到來，也讓陳霸先感到渾身不自在，王僧辯與陳霸先之間的關系隨之出現了一絲裂痕。
陳霸先原本與王僧辯並不是同僚，隻是在討伐侯景的過程中走到了一起，在蕭繹陣營中，王僧辯是嫡系，陳霸先則是草根。
陳霸先以討伐侯景為名，逐漸壯大了自己的力量，而蕭繹則利用陳霸先加入也增添了討伐軍的實力，二者各取所需。
白茅灣之盟前，王僧辯對陳霸先非常忌憚，白茅灣盟誓後，討伐軍確立了以王僧辯為主帥、陳霸先為副手這一格局，從表面上王僧辯將陳霸先的部隊納入了自己的管轄之下，但陳霸先擁有很大的自主性。
消滅侯景之後，南梁面臨的局勢並沒有得到改觀。
先是陸納的叛亂，王僧辯讓陳霸先鎮守建康，自己親率大軍西進，而後，江陵被圍，北齊南下，王僧辯與陳霸先二人相互支持，苦苦支撐著危局。
陳霸先鎮守京口之後，王僧辯極力進行拉攏，想在兩人之間構建像廉頗、藺相如那樣肝膽相照的同僚關系。
王僧辯答應為第三子王顛娶陳霸先的女兒為妻，正要舉行婚禮，卻碰上王僧辯的母親去世了，婚事遂耽擱了下來，然而，兩家之間很親密。
親密歸親密，但王僧辯對陳霸先並非沒有一點提防。
消滅侯景後，王僧辯在把京口之地交給陳霸先的同時，又任命自己的心腹在京口附近任職，多多少少有監視和牽制陳霸先的意味。
王僧辯迎立蕭淵明是他審時度勢的結果，但陳霸先堅持認為不可，在此之前，他從京口派遣使者到建康反復表達了反對意見，使者往返四次，可是王僧辯沒有采納，這讓陳霸先非常惱火。
陳霸先反對迎立蕭淵明的真實理由已無從得知了，但絕對不是所謂的忠臣想法，其真實目的大約是貪圖幼主容易被控制。
蕭淵明的到來讓他的如意算盤落空了，並且，由於此前的反對態度，陳霸先也擔心等到蕭淵明羽翼豐滿之後，自己將死無葬身之地。
另外，王僧辯之所以將自己安置在位置相對重要的京口，就是讓自己抵禦來自江北的北齊的威脅，如今，北齊的威脅已經消除，下一步，王僧辯很有可能會把矛頭對準自己。
想到這裡，陳霸先遂加緊了發動叛亂的步伐，他下令秘密趕制了數千件戰袍，並準備了大量金銀、綢緞，以備將來賞賜之用。
正當陳霸先暗中計劃偷襲建康時，恰巧江淮之間有人向王僧辯報告說齊軍在壽陽聚集了大量軍隊，王僧辯判斷齊軍將要南下，遂派遣記室參軍江旰前去京口，通知陳霸先，讓其早做準備。
《南史》稱∶『時壽春竟無齊軍，又非陳武之譎，殆天授也』此時，南梁與北齊已經成為盟友，北齊沒有必要進攻南梁，但是，為何王僧辯又堅持稱北齊會南下呢？
實際上，壽春並無北齊軍隊，這一傳言也並非陳霸先有意所為，那麼，究竟是誰制造了這一謠言？
在陳霸先與王僧辯的這場生死對決中，出現了不少匪夷所思的事情，這僅僅是其中之一。
見江旰前來，陳霸先決定將計就計，立即發動政變。
種種跡象表明，在蕭淵明登基後，建康與京口之間已經發生了十分微妙的變化，王僧辯是否也想清除陳霸先，這已經不得而知了，但至少他還沒有完成部署，也對陳霸先會突然發動襲擊缺乏預見性，沒有引起足夠的重視，那麼，王僧辯為什麼要派江旰前來京口呢？
是探聽虛實，還是別有所圖？
可能都不是，這是因為，據《梁書》稱，王僧辯對陳霸先毫無防備之心，他萬萬沒有想到自己的準親家竟然會違背盟誓，幹出偷襲自己的事情。
陳霸先把江旰扣留了下來，九月二十五日，他召集部將侯安都、周文育、徐度和杜棱四人商議。
聽了陳霸先的話，杜棱擔心事情難以成功，陳霸先擔心杜棱會泄露，掏出手巾猛勒杜棱的脖子，將他勒昏過去，關在房中。
當晚，陳霸先即集合部隊，賞賜將士們，命侄兒陳曇朗鎮守京口，徐度、侯安都率領水軍直指石頭城，他親率騎兵、步兵從江乘縣的羅落橋《江蘇省儀征市境》出發，約定在石頭城下會師。
部隊出發後，陳霸先這才把杜棱喊到身邊，一起出發。
當時，軍中隻有薛安都他們四人知道這次行動的目的，全軍將士都認為是聽從江肝的召喚，前夫建康抵禦北齊軍隊，絲毫沒有懷疑陳霸先會發動政變。
九月二十七日，侯安都率領水軍將要朝石頭城撲來，可是，陳霸先的步兵毫無動靜。
侯安都見狀大為恐懼，他趕上陳霸先罵道∶ “今天你我是當叛賊的，已無法回頭了！是生是死，立馬就能見出分曉，你拖著屁股躲在後面還想幹什麼！如果失敗了，你我都是死路一條，難道你晚點行動就不被砍頭了嗎？
”陳霸先聽了，說道∶”侯安都罵我了！”遂揚鞭前進。
石頭城的北面是丘陵地帶，不太險峻，侯安都的軍隊來到石頭城外，即棄舟登岸。
來到城下，侯安都身披鎧甲，手持長刀，讓士兵們將他抬起，扔進城墻之內，將士們遂依次翻進城內，與此同時，陳霸先的軍隊也從南門殺入城內。
王僧辯正在石頭城內辦公，聽說城外有軍隊，還沒等他弄明白，又有人慌慌張張跑來說外面的軍隊已經殺進城內了！錯愕之餘，王僧辯慌忙從辦公室逃出，與兒子王傾率領數十名貼身侍衛在辦公室門前苦戰，但終因寡不敵眾，隻好返身登上南門城樓之上。
在城樓上，王僧辯向陳霸先叩頭請求饒命，但陳霸先不為所動，並縱火焚燒城樓，不得已，王僧辯等人這才從城樓上下來，束手就擒。
陳霸先劈頭蓋臉問王僧辯∶”我有什麼罪過，你竟然將與北齊軍隊一起討伐我？
”又說了一句∶”為啥你竟毫無戒備？
”王僧辯回答∶”將北方防守都完全交給了你，怎麼說沒有戒備？
”陳霸先問的這兩句話，之所以顯得非常突兀，很有可能是因為他的第一句問話下面，史家省略了王僧辯的回話。
陳霸先說第一句話大約是說給自己身邊的將士們聽的，以證明自己這次行動的正當性，而王僧辯的回答極有可能揭露了陳霸先背信棄義的嘴臉，史家不敢如實記載吧？
當晚，陳霸先即下令勒死了王僧辯父子。
前青州刺史程靈洗率軍救援王僧辯，在石頭城的西門與陳霸先的軍隊激戰多時，戰敗，陳霸先派人勸降，程靈洗猶豫很久才投降。
陳霸先覺得此人重節義，盡釋前嫌，任命他為蘭陵太守，讓他率軍東進協防京口。
九月二十八日，陳霸先向各地發佈文告，列舉了王僧辯的種種罪行，並說∶ “隻殺王僧辯父子兄弟，其餘親戚朋友，一概不究。
“