關於袁崇煥之死，無論是官方編撰的史書，還是民間編撰的史書，無一例外都說袁崇煥是被凌遲而死的。
如《明季北略》載：『時百姓怨恨，爭啖其肉，皮骨已盡，心肺之間叫聲不絕，半日而止』；《廿二史札記》載：『楊監奔還大內，告於帝；帝深信不疑，遂磔崇煥於市』；《罪惟錄》載：『其時群論嘩言，無知之良輩爭啖其肉以食其恨』；《崇禎長編》載：『於鎮撫司綁發西市，寸寸臠割之。
割肉一塊，京師百姓從劊子手爭取生啖之 』。
因此，袁崇煥是以什麼樣的方法死亡的，這並沒有什麼好說的。
我們現在來說說，崇禎皇帝為何要以凌遲這樣殘酷的刑罰來處死自己曾經信賴無比的袁崇煥呢？
首先，袁崇煥失去了崇禎皇帝的信任。
眾所周知，崇禎皇帝繼位後大力鏟除閹黨，勤於政事，生活節儉，厲行節儉，平反冤獄，為大明天下曾六下罪己詔，是個年輕有為之君。
但是，因年幼時那段不幸的經歷，造就其性格是『性多疑而任察，好剛而尚氣』，就是性格多疑，不信任何人，且容易被他人言語左右。
朱由檢
雖然，在崇禎皇帝在位之時，他曾感嘆：『臨朝浩嘆，慨然思得非常之材，而用匪其人，益以僨事』，就是崇禎皇帝希望能得到非常之材，但卻未能如願，常常是所用非人。
崇禎皇帝雖希望能得到有用之材，可真到用人時，他往往是『任察則苛刻寡恩，尚氣則急遽失措』，在位十七年，所殺大臣不計其數，包括總督7人，巡撫11人，內閣重臣更替更是頻繁，先後用了五十人左右。
試問就是這樣猜忌的崇禎皇帝，他如何能得到非常之材呢？
最初，崇禎皇帝的確是很信任袁崇煥的，崇禎皇帝四月登基，七月就詔袁崇煥來朝，咨以方略。
在討論如何平定遼東之亂時，袁崇煥的平遼方略讓崇禎皇帝十分滿意，為此，崇禎皇帝與袁崇煥說道：『復遼，朕不吝封侯賞。
卿努力解天下倒懸，卿子孫亦受其福』。
可以說，在最初，因袁崇煥『計五年，全遼可復』的豪言壯語，所以他是很得負有雄心壯志的崇禎皇帝的信任。
但是，如前文所說，崇禎雖是有為之君，但卻也是一個多疑之君，一旦在這五年間，袁崇煥出現任何的差錯，崇禎皇帝對他的信任就會蕩然無存。
事實上，最後事情的發展，也的確如上所說。
袁崇煥
崇禎二年《1629年》十月，就是在袁崇煥先斬後奏斬殺毛文龍的三個月後，皇太極輕裝簡行率軍突然繞開了袁崇煥苦心經營的關寧錦防線，取道內蒙，直逼京師，這就是歷史上著名的『己巳之變』。
己巳之變是明與清交戰以來，清軍第一次攻擊北京，直接威脅到朱由檢的安全及明朝的國本，這個事件出現後，再加上他曾經在不經請奏就直接殺掉毛文龍的做法，其導致的最直接的後果就是朱由檢對袁崇煥的看法發生了根本的改變，由曾經的寵信變成了不滿。
其次，在已經讓朱由檢不滿的情況下，袁崇煥在沒有征得朱由檢的前提下，擅自與後金議和的事情又被人揭發，他曾『遣使報之，崇煥欲議和，以書附使者還報』。
此後，在『己巳之變』後，皇太極又放出風說，他繞過關寧錦防線，是與『袁巡撫有密約』，其兵困京城是為了迫使朝廷同意袁崇煥與後金的和談。
此外，皇太極為了讓這個謊言能更加真實，他還故意讓被俘『獲明太監二人』偷聽到袁與後金私下交易的信息，然後故意讓他們逃走，以此讓他們有機會『詳奏明帝』。
如此，隨著這些事情的發生，這更是讓朱由檢由不滿直接變成了猜忌。
袁崇煥
隨後，在朱由檢完全不信任袁崇煥的情況下，再隨著朝中重臣和民間百姓都認為袁崇煥可殺的局勢下，袁崇煥不可避免地就走向了死亡。
當時，在該如何處置袁崇煥時，朱由檢曾征詢閣臣及文武諸臣的意見：『卿等已知之，今法司罪案雲何？
』，而當時多數重臣的回答都是：『其罪不宥』。
同時，當時，不但是朝堂上支持殺袁崇煥，在民間亦也是支持殺袁崇煥，自己巳之變發生後，民間一直都有著『都人驟遭兵，怨謗紛起，謂崇煥縱敵擁兵』的傳聞，因此，基於這個說法，當時百姓都認為袁崇煥是咎由自取，而正是因為大多數百姓都秉持著這個想法，也才有了『於鎮撫司綁發西市，寸寸臠割之。
割肉一塊，京師百姓從劊子手爭取生啖之 』的景象。
最後，在袁崇煥下獄後，部將祖大壽、何可綱率數萬關寧兵嘩變，朱由檢詔諭祖大壽，讓其安撫兵士，可『祖大壽拒不從命』。
後，朱由檢又讓孫承宗去安撫嘩變兵士，『孫承宗亦令遊擊石柱國馳撫諸軍』，可袁軍亦然是不聽命令，且更是『持弓刀相向』。
而就在這關頭，皇帝聖旨都不能安撫嘩變將士的時候，袁崇煥一紙手書居然就能讓袁軍停止嘩變。
想想看，對於朱由檢來說，這是何等的屈辱，將士們隻知有袁督師而不知有崇禎帝，袁督師的一紙手令竟比聖旨還能奏效，這讓朱由檢如何不憤怒，如何能放過袁崇煥？
所謂『諸有利於封疆者，皆不利於此身者也』，自此袁崇煥的命運可想而知。
如此，正是基於朱由檢對袁崇煥起了猜忌，認為袁崇煥在欺騙他，在愚弄他，再加上兵變這件事，而後滿朝文武，及黎民百姓又都認為袁崇煥該殺的情況下，袁崇煥不可避免地就走向了毀滅。
崇禎三年《1630年》八月，袁崇煥被朱由檢下令凌遲處死。