就稅賦管理和當地駐軍而言，明朝對西藏的治理是最沒有存在感的。
元朝收稅則沿襲蒙古帝國對外族統治收稅的一貫策略，即委托制或授權制，駐軍是象征性的。
而清朝對西藏的管治是卓有成效的，駐軍和稅收管理的力度和強度超越了元明時代和以後的民國時代。
三、稅賦管理
元朝在西藏地區征收賦稅包括兩部分，即上繳朝廷的賦稅和上繳薩迦地方政權的賦稅，且基本上是通過薩迦地方官員征收。
藏文史書記載，本欽雲尊即曾經擔任過為朝廷征稅的『稅務官』。
蒙元時期治理西藏有兩個顯著特點，一是分封諸王子在西藏的勢力范圍，二是依賴藏傳佛教尤其是薩迦派的勢力。
因此，在西藏地方推行的最引人註目的政策之一是人口普查，即所謂括戶，其內涵前後各有不同：蒙古汗國時期的括戶主要是為了對蒙古諸王、勛貴進行分封，元朝以後的括戶主要目的則是為了保證朝廷稅、役的征發。
宣政院印
元朝在西藏征收的稅賦包括四類，即丁稅、地稅、商稅和驛站差稅，其中丁稅是主要稅種。
丁稅也就是『人頭稅』，即依據諸戶人丁數交納，這也是元朝在西藏括戶的主要目的之一，把藏區共劃分為13個萬戶來管理。
元朝規定，工匠、僧、道、也裡可溫、達失蠻、儒戶等繳納地稅。
但丁稅和地稅不重復交納。
商稅就是在藏文史書中所看到的『什一稅』，『歲甲午《1234年》始立征收課稅所，以征商賈之稅。
初無定額，至元七年《1270年》立法，始以三十分取一』《註：蘇天爵：《國朝文類》卷40。》此後不斷增加商稅的征收數額。
為加強與藏地的聯系，元中央政府在西藏地區推行驛站制，並征收驛站差稅，包括服役和繳納物資。
當然，元朝為鼓勵僧侶貴族在西藏征收稅賦的積極性，對僧侶貴族和寺院進行免征或優惠。
佛寺享受免征
元驛站圖
由於明朝對西藏的管治比較弱，是弱化版的土司制度，所以稅賦征收看起來更象朝貢和貿易。
明朝對西藏的稅賦主要是實物稅和勞役稅兩個方面。
實物稅主要指征馬，洪武十六年，朱元璋就建立了差發馬制度，要求西藏地方按戶征馬，按照規定數目繳納馬匹。
分兩種形式，一種是西藏番僧入貢，一種是直接征收至茶馬司和衛所。
勞役則指明朝繼承元朝的驛站制，征發西藏諸王、各衛、各族修建和維護驛站、道路。
還有一種經濟往來不象稅賦，更象貿易，即與藏區茶和鹽的貿易。
洪武五年，朱元璋設立茶馬司與茶鹽轉運司，通過茶馬古道實現對藏貿易。
而鹽和茶當時是藏族最缺乏的物資，通過對這些物資進藏的管制，從則實現在經濟上對青藏地區的鉗制。
茶馬古道路線圖
茶馬古道
在1792年以前，清朝對西藏的管理是以冊封為主，類似羈縻的性質，免除西藏地方每年向中央王朝所納的賦稅，以采邑的形式賞給達賴喇嘛和班禪額爾德尼，西藏地方所有的財政收入均歸其自行支配。
1792年清朝派福康安率大軍入藏驅逐了入侵的廓爾喀軍隊以後，對西藏地方的財政狀況進行了徹底的清查，並把財權收歸中央。
1793年頒行《欽定西藏善後章程》，明確規定由駐藏大臣對西藏財政稅收進行審計監督，包括稅收科目、征收數量、賦稅期限和賦稅減免權限。
道光二十四年(1844年)，清政府因駐藏大臣琦善的奏請，下令今後西藏地方財政聽其自理，駐藏大臣毋庸經管，至此又恢復到了1792年以前的狀況。
欽定藏內善後章程
由於封建農奴制度的阻礙，加之艱苦的自然條件，西藏地方生產力極其不發達，社會經濟極端落後，所以，清王朝在蠲免西藏地方的賦稅、加強對西藏地方財政監督稽查的同時，又以賞賜、俸祿等多種方式，對西藏地方予以大量的財政補貼。
四、駐軍防衛
元朝除在中央設總制院管轄西藏地方的軍政和宗教事務外，下設烏斯藏、納裡速、古魯孫等三路宣慰使都元帥府，具體負責處理西藏軍政事務；於阿裡設元帥二人管理軍務，於衛藏地區設都元帥二人管理當地蒙古駐軍。
因此，元朝在西藏是駐有軍隊的，並由一位王子及其後裔率軍駐守西藏地區的東部邊緣，逢西藏有事，即可就近入藏，以盡鎮戍邊疆的職責。
1290年，一名萬戶長叛亂，元朝中央派遣這位王子率軍入藏平息。
到十四世紀元末時，駐在西藏的蒙古軍已大為減少，隻是負責保衛驛站，以致連統率蒙古軍的旬傑都元帥隻能把聯軍統帥的職位讓給帕竹萬戶長，對各地方勢力的混戰也不能起到控制的作用。
蒙古軍隊
明朝則從未在西藏派駐軍隊。
朱元璋稱帝後於1370年派兵攻占河湟地區，逼近青藏高原，以武力逼迫西藏僧俗貴族納入明朝管理。
永樂年間，朱棣曾想『動用軍隊，仿行元代故事，將烏斯藏納入法治』。
但是大寶法王認為佛法應『自在自如宣揚，不便派遣漢軍前往』。
於是，駐軍一事也就不了了之。
此後終明一朝，也沒有在西藏地區駐過軍。
明西藏周邊軍隊衛所
清朝前期，西藏與中央王朝的關系以羈縻為主，以蒙制藏，由達賴和蒙古貴族實際統治西藏。
但在遭受外族侵略時，清朝中央政府始終派軍隊前往西藏支援。
如1717 年準噶爾部攻入拉薩，殺死拉藏汗，囚禁六世達賴時，清軍在1718 年至 1720 年間，兵分兩路入藏，驅逐準噶爾，隨後清政府留軍兩千駐防。
1721 年再由雲南、四川各調 500 名兵丁入藏，這樣，在藏兵丁共計3000 名。
1724 年《雍正二年》，噶倫內亂，康濟鼐被殺，中央政府派軍入藏平息叛亂。
1750 年《乾隆十五年》發生珠爾默特那木札勒內亂，清廷派四川總督策楞領兵入藏平叛。
1793年，乾隆派兩廣總督福康安率軍入藏驅逐廓爾喀侵擾後頒佈《欽定藏內善後章程》，對西藏原有的 6000 餘名松散藏軍加以整頓，定額整編3000 名，另從內地調駐西藏各地官兵1400多名，並以此成為軍隊駐藏定制。
駐藏清軍
然而，到了清代末期，隨著英國將魔爪伸向西藏，挑起『土鼠年戰爭』和『木龍年戰爭』，與清廷簽訂《中英藏印條約》，將西藏拖入失控的泥沼，朝廷對西藏的統治有心無力，駐藏大臣對駐藏軍隊失去控制權，藏軍漸漸落入以達賴為首的西藏僧俗貴族之手。
達賴依靠英國支持，將藏軍打造成為了自己的私人武裝。
駐藏大臣印
我是傾城地笑，敬請批評指正。