因為華佗觸犯了曹操的底線和威嚴。
對於華佗的死，現在比較流行兩種說法。
第一種是像《三國演義》中所說，曹操犯了頭痛病，然後找來華佗為其醫治，按照華佗所說，是要先用麻醉，然後砍開頭顱，方能徹底醫治，曹操一聽，懷疑華佗是謀殺自己，所以把他下獄拷打致死。
本人對這個看法是存懷疑態度的，不是不相信華佗的醫術，而是懷疑當時的醫療環境怎麼可能達到開顱這麼高的境界呢。
所以本人認為這種說法是不靠譜的。
第二種說法是，曹操有頭痛病，就把華佗找來專門為他治病，華佗就跟曹操說，你這種病是慢性病，短時間很難治好，長期治療的話也隻能延長壽命而已。
曹操聽後，雖然心中不悅，但也沒怎麼處置華佗。
可能是華佗長時間在外行醫，采藥行走，不希望被拘束在一個地方太久，於是就措辭說家中來信要回去，回家之後就以妻子有病為由長時間不返回，曹操幾次催促都無結果，非常生氣，於是曹操派人前去調查華佗所說是否屬實，如果屬實就放寬假期，賜予禮物，如不實就帶回問罪。
結果華佗說謊被定罪，雖然有荀彧勸說曹操，但最終還是死於獄中。
我認為這種說法是站得住腳的，華佗主要是因為不想受到拘束，要在世間行走行醫的，主觀意識認為曹操不會輕易殺害他。
但是作為一方霸主的曹操來說，絕對不會容忍一個平民再三的欺騙自己，況且是幾次三番都是如此，而且那時醫生的這種職業是不被看中的，是屬於賤業的一種。
所以說曹操會為了他是一個醫生而手下留情嗎。